Det är inte alltid en upphypad uppföljare säljer lika mycket som sin föregångare, även om spelet faktiskt är bättre. Detta gäller i fallet Metroid Prime. Under julhandeln så sålde Metroid Prime 2: Echoes cirka 470.000 exemplar, vilket i sig inte är usla siffror. Däremot är de sämre än vad Metroid Prime sålde under samma period anno 2002. Då kom spelet upp i 722.000 ex, och totalt har originalet nu sålts i 1,2 miljoner exemplar.
Anledningen sägs vara att att uppföljaren utrustats med en Teen-rating, vilket hindrade många yngre att köpa spelet och därför tappade man lite i försäljning.